对于通过凝胶分离获得的样品,应该要考虑到凝胶染色方法对后续的质谱分析的影响。不同的染色方法与质谱分析的兼容性是不同的。最近,针对考马斯亮蓝染色试剂进行了许多改进,使其灵敏度更高,几乎接近了银染法,同时保持了较好的线性动力学范围,在许多研究中得到了应用。荧光染色法是新兴的染色方法,在蛋白质组学研究中也得到了比较多的应用,如SYPRO Ruby就是其中一种荧光染色试剂,其灵敏度可达到1ng,线性动力学范围也较宽(2~2000ng),因此定量更加准确。但是不论哪种荧光染料,其缺点是代价较银染和考马斯亮蓝染色要昂 ......